公司能否合法地对员工罚款1000元？

公司不能合法地对员工罚款1000元。依据《劳动部关于印发的通知》，公司无权罚款，只能按约定要求赔偿经济损失，且扣除工资有限制。未经合法程序罚款，可能引发劳动纠纷，损害公司声誉。
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公司不能罚款。处理方式：1.若员工造成经济损失，可按约定要求赔偿，但扣除工资需合规；2.依据公司规章制度进行纪律处分，如警告、记过等；3.严重违规可解除劳动合同，但需确保解除行为合法。每种方式均需遵循相关法律法规，避免不当处理。
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公司处理员工违规的常见方式是要求赔偿经济损失或依据公司规章制度处理。选择时应考虑违规性质、损失大小及公司规章制度，确保处理合法合规，避免法律风险。